O ânus é formado internamente por uma camada de tecido chamada de mucosa anal e por duas camadas de músculos esfincterianos, uma externa e outra interna.
O canal anal é a porção entre o ânus e o reto. A metade superior da mucosa anal é um tecido que se assemelha ao do intestino grosso. A metade inferior da mucosa anal é um tecido mais semelhante ao da pele, mas sem pelos ou glândulas. É nesta parte da mucosa que surgem os cânceres do canal anal, que são classificados como carcinomas de células escamosas.